La orden de suspensión habría sido solicitada por la Fiscalía General de la República (FGR) y no por la unidad encargada del caso. Las órdenes habrían sido dejadas sin efecto el 13 de setiembre según el diario El País.
Las pruebas recogidas por le medio indicarían un conflicto entre la fiscalía encargada del caso, dirigida por Omar Gómez Trejo y la FGR, a cargo de Alejandro Gertz Manero. Según averiguaron, las cancelaciones no partieron de la Unidad Especializada en Investigación y Litigación del Caso Ayotzinapa (UEILCA) de Gómez.
Asimismo, se señala que de las 83 órdenes solo se han ejecutado un total de 4. Entres estas órdenes canceladas se encontraría la de 16 militares acusados de delincuencia organizada. Entre ellos está el comandante del 41 Batallón de Infantería de Iguala en 2014, Rafael Hernández Nieto.